Sistematika Mikroba

Semester	:	5
Kode Mata Kuliah	:	BFM305
Prasyarat	:	Mikrobiologi
Deskripsi Singkat	:	Konsep dasar biosistematik, sejarah biosistematik mikroba, penggunaan karakter-karakter dalam sistematika, klasifikasi mikroba, identifikasi mikroba, taksonomi numeric dan polifasik, filogenetik, nomenklatur dan aplikasi probe asam nukleat dalam system biosistematik mikroba dan mikrobiologi.
Tujuan	:	Mahasiswa mampu memahami mengapa mikroba diklasifikasi dan bagaimana mikroba dinamai, membedakan antara karakter fenotip dengan karakter genotip pada mikroba, mengetahui prinsip-prinsip dan teknik molekuler untuk identifikasi mikroba, dan mengetahui secara teori maupun praktik identifikasi dan klasifikasi mikroba serta hubungan kekerabatan dan evolusinya.
Materi	:	(1) Pengantar umum : Sejarah, pengertian, tujuan dan ruang lingkup sistematika mikroba; (2) Prinsip-prinsip dasar dalam biosistematika mikroba; (3) klasifikasi mikroba dan konsep spesiasi mikroba; (4) Identifikasi mikroba, taksonomi numeric, taksonomi polifasik; (5) Kerangka taksonomi dan filogenetik untuk sistematik mikroba; (6) Rekonstruksi dan interpretasi pohon filogenetik, batasan dalam rekonstruksi pohon filogenetik, presentasi pohon filogenetik; (7) 16S rRNA sebagai molekul marker untuk sistematik mikroba, beberapa kekurangan 16s rRNA gene sequence analisis; (8) Analisis pembanding untuk marker filogenetik alternative, beberapa keurangan marker filogenetik alternative; (9) Dasar pemikiran untuk 16s rRNA-derived backbone untuk Bergey’s manual; (10) Pohon filogenetik berdasarkan pada small subunit rRNA; (11) Nomenklatur mikroba;(12) Etimologi nomenklatur mikroba; (13) Teknik identifikasi molekuler; (14) aplikasi probe asam nukleat dalam system biosistematik mikroba dan mikrobiologi.